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1 | This spreadsheet contains a summary of the top 50 most frequent clinical observations extracted from the clinical notes of patients tested for SARS-CoV-2 at Stanford Health Care, between 07/01/2020 and 07/31/2020. | |||||||||||||||||||||||||
2 | The data were collected from the first hour of each patient's visit to the ED. | |||||||||||||||||||||||||
3 | Each row represents a clinical observation mentioned in at least 10 patients' records | |||||||||||||||||||||||||
4 | Do not sum counts or proportions across rows, because that will doublecount patients. | |||||||||||||||||||||||||
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7 | Total Patients | 8636 | ||||||||||||||||||||||||
8 | Positive for SARS-CoV-2 | 790 | ||||||||||||||||||||||||
9 | Negative for SARS-CoV-2 | 7846 | ||||||||||||||||||||||||
10 | P(+ve) | 0.091 | ||||||||||||||||||||||||
11 | P(-ve) | 0.909 | ||||||||||||||||||||||||
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13 | Description of DATA columns | |||||||||||||||||||||||||
14 | Count (observation) | The number of patients with at least one mention of the observation in a clinical note. | ||||||||||||||||||||||||
15 | Count (observation & +ve) | The number of patients with at least one mention of the observation in a clinical note and who tested positive. | ||||||||||||||||||||||||
16 | Count (observation & -ve) | The number of patients with at least one mention of the observation in an clinical note and who tested negative. | ||||||||||||||||||||||||
17 | P(observation) | Percentage of patients with at least one mention of the observation in a clinical note. | ||||||||||||||||||||||||
18 | P(observation|+ve) | Percentage of patients with at least one mention of the observation in a clinical note among those who tested positive. | ||||||||||||||||||||||||
19 | P(observation|-ve) | Percentage of patients with at least one mention of the observation in a clinical note among those who tested negative. | ||||||||||||||||||||||||
20 | P(+ve|observation) | Conditional probability of positive test result given mention of the observation: P(+ve|observation) = P(observation|+ve) x P(+ve)/ P(observation) | ||||||||||||||||||||||||
21 | P(-ve|observation) | Conditional probability of negative test result given mention of the observation: P(-ve|observation) = P(observation|-ve) x P(-ve)/ P(observation) | ||||||||||||||||||||||||
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